Datos del proyecto:
- Organismo financiador: Comisión Europea / European Health and Digital Executive Agency (HADEA)
- Programa: EU4Health Programme
- Nº proyecto: 101113109
- Nº de socios: 1 (ISCIII beneficiario principal) + 22 entidades afiliadas que pertenecen a la Red Nacional de Laboratorios de Secuenciación Genómica (RECOLECOV) de España
- Participantes del Sistema Regional de Salud: Servicio Murciano de Salud, FFIS (Entidades afiliadas al ISCIII)
- Otros participantes de la Región de Murcia: No hay
- Fecha de inicio y fin: 01/06/2023 – 30/06/2025
- Duración: 24 meses
- Máxima contribución de la EU para el proyecto: 1.760.336,60€ (80% de los costes elegibles);
- Máxima contribución de la EU para la Región:56,864,63€ (SMS + FFIS);
- Área(s):Whole Genome Sequencing (WGS), Reverse Transcription Polymerase Chain Reaction (RT-PCR), SARS-CoV-2
- Web del proyecto: https://relecov.isciii.es/
Resumen del proyecto:
En RELECOV 2.0, la atención se centrará en la identificación de variantes circulantes de preocupación (VOC), linajes y sublinajes del SARS-CoV-2, así como la identificación de nuevos linajes y sublinajes emergentes. Como objetivo principal del proyecto, se pretende aplicar herramientas de secuenciación del genoma completo (WGS) a la vigilancia genómica del SARS-CoV-2 y ampliar la vigilancia genómica a otras infecciones virales respiratorias, como la gripe estacional o el virus respiratorio sincitial (VRS), a través del establecimiento de una estructura nacional que mejore la experiencia de los miembros de la Red RELECOV.
Un segundo objetivo del proyecto sería la consolidación de la Plataforma RELECOV, a través de protocolos adecuados para la gestión de datos genómicos, definiendo metodologías conjuntas de secuenciación y análisis, incluidos controles de calidad, y desarrollando herramientas computacionales para la automatización del análisis, visualización e intercambio de datos genómicos con bases de datos internacionales. A largo plazo, contribución a una mejor preparación para lograr abordar oportuna y eficientemente los brotes transfronterizos de enfermedades infecciosas y pandemias en el futuro.
Acciones a desarrollar por el grupo de investigación en la Región de Murcia:
- Valoración de las técnicas de secuenciación en uso, material disponible en el laboratorio y planteamiento de posibilidad de mejora
- Revisión de la metodología empleada para el análisis bioinformático de los resultados y planteamiento de mejora
- Profundización en la metodología del análisis de secuencias
- Valoración de las técnicas disponibles para secuenciación del virus de la gripe y VRS y su implantación en el laboratorio
Reflexiones del grupo de investigación regional:
Gracias al desarrollo de este proyecto la capacidad de secuenciación de nuestro laboratorio ha mejorado sustancialmente, aunque sigue siendo fundamental contar con un apoyo bioinformático y con la posibilidad de mejorar la metodología disponible de secuenciación masiva para seguir avanzando en este tipo de técnicas.
Así mismo, la posibilidad que ofrece este proyecto de estar comunicados con el resto de laboratorios RELECOV nos permite compartir nuestra experiencia y continuar formándonos en esta tecnología.
Los resultados obtenidos han permitido realizar un estrecho seguimento del virus SARS-CoV-2 y ver como ha ido evolucionando en el tiempo. Esto además ha contribuído a dar una respuesta de forma rápida por parte de las autoridades sanitarias en nuestra región.
